后再逐步建立枪炮局生产武器，减轻将来南征两广的后勤压力。
军事方面，遵从吴超越的指令，兵分两路入滇的湖南吴军江忠济部和四川吴军李续宾部，也已经在云贵清军的帮助逼近了云南贼军的老巢大理城，贼首杜文秀一边负隅顽抗，一边寄书乞降，表示愿意帮助吴军攻打清军。然而吴超越闻讯之后却断然拒绝，仍然命令吴军全力攻打大理，不惜代价歼灭大理贼军主力。
最终，在祺祥元年的正月初五这天，吴军将士终于还是用地道攻城战术炸开了大理城墙，攻入了大理城内，杜文秀服毒自杀，事前得到过吴超越洗劫全城允许的吴军将士大开杀戒，基本歼灭贼军主力，平定了云贵境内规模最大的贼军。
大理战事结束后，吴超越当然是在第一时间抽调李续宾和江忠济这两支军队北上，返回湖南境内休整，兼职镇守地方，轮换湖南吴军主力北上湖北，准备向满清朝廷最后的钱粮供应地山西发起进攻。
对于吴超越抽调云贵境内吴军北上的这个决定，云贵总督吴振械、云南巡抚桑春荣和贵州巡抚刘源灏都寄书表示了强烈反对，无不担心这么做会导致贼势复燃。而早就被云贵战场拖后腿拖得满肚子火气的吴超越却根本不听，给吴振械等人的回书上也明白说道：“再有贼军复起，你们先收拾，收拾不了也没关系，等我打下了京城平定了乱党，再回过头来给你们帮忙！”
除此之外，吴超越又对云贵境内的人事任命做了重大调整，除了没动一督两抚之外，其他能换的人吴超越全都换上了自己人，也乘机把吴振械等人的心腹亲信调出云贵，架空满清朝廷事前任命的一督两抚，提高他们的反叛难度。
事情到了这步，吴振械、桑春荣和刘源灏三人也明白了吴超越从来没有信任过他们，可是没有办法，云贵的财政收入注定了他们没办法造反对吴超越形成威胁，同时又被境内贼军牵制，让他们就是想割据独立都难入登天。所以无计可施之下，吴振械等人也只好忍气吞声的继续为吴超越卖命，做两手准备——如果满清朝廷能咸鱼翻身就投降反正，如果吴超越真有当皇帝的命，就真的给吴超越当忠臣顺民。
吴超越的军队部署调整即将完成到位的时候，洪仁玕也再一次出现在了吴超越的面前，代表杨秀清向吴超越提出了联手北伐的要求，要求吴超越从已经被吴军拿下的许州出兵北上，先取开封后渡黄河，杀入直隶境内，帮太平军分担北伐压力，也给吴超越乘机直捣京城的机会。
洪仁玕才刚把话说完，吴超越就已经知道杨秀
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