因寡不敌众城破被擒。面对清军的高官厚禄，他毅然选择面向京师三拜后自缢而亡，时年七十六岁。另外他的五个儿子，六个孙子，两个侄子，八个侄孙全部战死，可谓一门忠烈。
朱由检闻讯后哀伤悲叹，对他的评价是“汉则孔明，唐则裴度。旧辅孙承宗前劳难泯，死义更烈”，之后南明弘光帝朱由崧追赠太师，谥号“文忠”。
左战对孙承宗是非常推崇的，这也是为什么一开始就拜他为师，并授予少傅的头衔，非常时期又命他做蓟辽总督、兵部尚书。把努尔哈赤一家幽禁在高阳，无形中就多了一道护身符，即便将来皇太极再次反叛，左战也不会担心孙承宗一家的悲壮重演。
魏进忠走后，左战又单独召见了兵部右侍郎李邦华，此人去年调入军机处参与大明王朝的高级军事决策，他的第一项任务就是配合孙承宗整饬京营。所谓新官上任三把火，加上他有皇帝撑腰，上任之初便携天子之威改组了四卫营，革除老弱、占役、虚冒的弊端，整顿军备，严苛训练，为曹文诏、黄得功组建的勇卫营成了辽东战场上的两把尖刀。
李邦华，字孟暗，江西吉水盘谷镇谷村人，名言是“我宁为偏枯的学问，不做反复的小人。”
说起这个李邦华有一件非常有趣的事情，万历三十一年他与父亲李廷谏一同中了举人，爷俩互相镞砺，第二年李邦华就考中了进士，当然他老爹落榜了。由于他与东林党人邹元标是同乡，所以上任之初就被贴上了东林党的标签，屡屡遭受排挤，他也不为自己辩解，索性称病回家。
左战登基后启用的第一批人就有他，在朝中挂了个右佥都御史的头衔就到天津做巡抚去了。俗话说是金子在哪里都能发光，他到天津后积极整顿军务，使津门军成为各镇的表率。左战见状立即将他调入兵部任右侍郎，与孙承宗一道成为军事改革的骨干力量。由孙承宗负责培养、选拨年轻的军事将领，开办军事院校，组建关宁铁骑和近代陆军。李邦华则革除军中弊端，惩处贪腐，保证军人的纯洁性和纪律性。
君臣见面自是一阵寒暄，闲扯几句后左战开门见山的问道：
“现在京营整饬的如何了？”
李邦华是个急脾气，立即回道：
“京营一向存在占役、虚冒的情形，臣惩治了十几个老奸巨猾的掾史，要求一年考察两次，目前已基本杜绝这种事情。不过军马只有一万五千匹，经常有官员借用坐班马，甚至折价把马匹买走了，臣建议军马是用来打仗的，以后取消借马的惯例。”
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