三公官秩为一万石。（《汉书•百官公卿表》颜师古注：“汉制，三公号称万石，其俸月各三百五十斛谷。”）
之所以司马前面要加大字，是为了和军中的官职司马加以区分。《汉官仪》曰：“元狩（西汉武帝的年号）六年罢太尉，法周制置司马。时议者以为汉军有官候、千人、司马，故加‘大’为大司马，所以别异大小司马之号。”
太尉虽然名义上负责军事，但手下并没有直属的军队，汉朝军队的指挥权都掌握在将军、中郎将、校尉的手中。东汉末年，三公的权力更是差不多被完全架空，政务尽归于权臣和三台，所以此处将太尉列入文官。其实如果要分辨某太尉是否是武官，只要看他有没有将军之类的加官，如大司马、骠骑将军霍去病，就可视为武官；而像汉末曹嵩之类，还是视为文官的好。
一八八年四月，太尉曹嵩辞官。曹嵩是曹操的父亲。
一八八年五月，汉灵帝以永乐少府樊陵为太尉；仅过了一个月，樊陵就被罢免。
一八八年七月，灵帝以射声校尉马日磾为太尉。
一八九年五月，马日磾被免官；灵帝以幽州牧刘虞为太尉。一八九年九月十二日，献帝（其实是董卓，当时董卓掌握大权）以太尉刘虞为大司马，董卓自封为太尉。一八九年十一月，（献帝）以董卓为相国。
一八九年十二月，献帝以司徒黄琬为太尉。
一九零年二月，董卓以灾异（天灾异变）为由，罢免了太尉黄琬和司徒杨彪。太尉主天，如果发生天灾，有司可以奏免太尉。天灾如大雨、冰雹、日月食等。司徒主人，国中如有大规模反叛，有司可以奏免司徒。《韩诗外传•第八卷第十九章》：“三公者何？曰司马，司空，司徒也。司马主天，司空主土，司徒主人。故阴阳不和，四时不节，星辰失度，灾变非常，则责司马。山陵崩竭，川谷不流，五谷不植，草木不茂，则责之司空。君臣不正，人道不和，国多盗贼，下怨其上，则责之司徒。故三公典其职，忧其分，举其辨，明其德，此三公之任也。”这一制度废除于魏文帝时黄初二年。《三国志•魏书二》：“戊辰晦，日有食之，有司奏免太尉，诏曰：‘灾异之作，以谴元首，而归过股肱，岂禹、汤罪己之义乎？其令百官各虔厥职，后有天地之眚，勿复劾三公。’”
一九零年二月，献帝（实际为董卓）以光禄勋赵谦为太尉。
一九一年七月，赵谦被免官，太常马日磾再度被任命为太尉。一九二年七月十三日，马日磾被升为太傅。
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