协还与众人商议了关于李傕，郭汜，牛辅等董卓附逆的处置方案。
经过一番商议，最终刘协下旨赦免了凉州诸将，并挨个为他们在关中寻找驻军之县，让他们能够歇兵，以安其心，待翌日刘协羽翼丰满之后再行图之。
至于董卓的家眷，刘琦则是将董旻献给了朝廷。
王允当即下令，将逆贼董旻处以极刑，并夷灭董卓三族。
这当中涉及了董卓九十岁的老母，也包括他十六岁的孙女，还有很多无辜的男男女女，牵扯之人愈以千计。
在袁绍和曹操这些古代人的眼中，这种处置方法并没有什么不妥，很正常。
古代就是这样，政治斗争中连坐属于常事，一人失势死一大片人，并没什么值得大惊小怪的。
但以刘琦的认知来说，将董卓最亲近的直系亲属处置了，倒也罢了，什么老母，孙女，兄弟姐妹之类的，这些人中虽然有些无辜，但毕竟跟董卓沾亲带故，以当权者的角度而言，没法留。
但有些人被董卓波及，就未免显得有些无辜。
三族包括，父族、母族、妻族。
只要是跟这里面搭上关系的，不管是什么八竿子打不着的关系，都得死。
什么七舅老爷、九大姑的小表弟，大姨父的倒插门表侄儿，可能有些人一辈子都没跟董卓见过一面的……不好意思，那也全都得死。
虽然觉得他们确实无辜，但刘琦并没有去为他们争取生还的权力。
认知归认知，但为了一群不想干的人去据理力争，多少就有些多余了。
而且他也确实争取不来。
事情敲定之后，众人又开始商讨起一件大事，就是迁都返回雒阳。
针对这件事，刘协请诸人谈谈自己的意见和想法。
刘琦第一个站了出来：“陛下，董卓的郿坞之中，虽有董卓搜刮的宝物和粮秣可以用于重建朝纲，但陛下若要重振天威，首在于人，依臣之下，陛下耽误之急，是要急召前番长安事变时，散落于各地的臣工，使他们返朝辅佐朝政，日后回返雒阳之后，方可使各官署重立。”
王允言道：“伯瑜放心，此事老夫已经处置了，假以时日，必有结果。”
刘琦又道：“太傅处事周全，令人敬佩，另外，尚有朝中军务必须要重视，温侯虽是天下名将，又是大汉股肱，但毕竟只有一人，如今天下纷乱，更兼董卓余党虽遭赦免，但凉州人皆朝秦暮楚之辈，不可尽信，需得有名将立于朝，与温侯同保
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